以下是个人软件南京著作权和企业软件南京著作权的申请流程，步骤如下：
一、填写计算机软件申请表
填写计算机软件申请表。填写内容主要包括软件全称、简称、版本号、开发完成日期、软件开发情况、原始取得权利情况、继受取得权利情况、权利范围、软件用途和技术特点、软件南京著作权拥有状态、申请者详细情况、软件鉴别材料交存方式、申请者签章。
二、申请者身份证明
个人申请者：（A4纸）
份证复印件以及——有工作单位：非职务软件开发证明（表格）。无工作单位：非职务软件开发保证书（表格）。外国个人需要提交护照或个人身份证明认证件。
法人单位申请者：（A4纸）
法人单位证明（表格）以及法人代表身份证复印件——企业法人：营业执照副本复印件。事业法人：事业法人代码证书复印件。民间组织：当地民政机关或主管部门批文复印件。台湾：营业执照复印件、公证书（当地法院）。香港：营业执照复印件、公证书。外国公司：营业执照复印件、认证书（中华人民共和国在驻所在国大使馆）。
非法人单位申请者：（A4纸）
非法人单位证明（表格）。申请人委托代理人代为办理软件著作权登记申请的，应提交授权委托书。
三、源程序
1份，A4纸，正面。按前、中、后各连续20页，或前、后各连续30页，共60页。（不足60页全部提交）第60页为模块结束页，每页不少于50行（结果页除外），在每页的左侧留出装订线，右上角打印或标注页号1—60.
四、需提供的文档
1份，A4纸，正面。用户手册、操作手册、设计说明书、使用说明书等任选一种
按前、中、后各连续20页，或前、后各连续30页，共60页。（不足60页全部提交）第60页为文档结束页，每页不少于30行（结果页除外），在每页的左侧留出装订线，右上角打印或标注页号1—60.（若希望多交文档，每多交一种文档需增加文档费）
五、权利保证书
个人申请者：必须有本人签字；
法人单位与非法人单位申请者：必须有法人代表签字并加盖公章。
六、酌情提交以下申请文件
申请登记软件为原创软件的版本说明，在高版本（2.0以上）软件作为原创软件申请登记或版本号有特殊定义时填写。
证明文件：若申请者存在以下情况，需提交以下文件：
合作开发——合作开发合同书或合作开发协议书1份A4纸。
委托开发——委托开发协议书1份A4纸。
下达任务开发——任务书1份A4纸。
